Кафедра была организована 1 февраля 1935 г. (приказ по Казахскому медицинскому институту № 8 § 9 от 19 января 1935 г.) и в первые годы создания носила название кафедры социальной гигиены. В 40-50-ых годах именовалась кафедрой организации здравоохранения и истории медицины.В 1966 г. переименована в кафедру социальной гигиены и организации здравоохранения с курсом истории медицины. В 1993-1998 гг. называлась кафедрой социальной медицины и управления здравоохранением с курсом истории медицины. С 1999 г. по настоящее время носит название кафедры общественного здравоохранения. Перемены названия кафедры и ее реорганизации отвечали задачам, которые ставились перед ней в определенные исторические периоды развития страны.
Организационный этап и становление кафедры связаны с деятельностью специалистов, направленных на работу в Казахстан Наркомздравом РСФСР. Здесь можно назвать имена первых заведующих кафедрой: Манзон С.А. – выпускник Пражского медицинского института, руководил кафедрой в 1935-1936 гг.; Попов Н.И. – окончил медицинский факультет I Московского государственного университета, заведовал доцентским курсом социальной гигиены в 1936-1938 гг. Ими успешно были выполнены задачи теоретический и практической разработки принципов социалистического здравоохранения, изучены вопросы хозрасчета в стационарах, принципы построения участковости, медико-санитарного обслуживания рабочих и тружеников села. В годы Великой Отечественной войны все внимание кафедры было сосредоточено на вопросах медико-санитарного обеспечения фронта и развертывания тыловых госпиталей, медико-социального обслуживания населения, включая эвакуированных лиц. В 1941-1943 гг. кафедрой заведовал Алфимов И.В. – выпускник медицинского факультета Уральского государственного университета. С 1943 г. по 1949 г. кафедрой руководил по совместительству министр здравоохранения Казахской ССР Чесноков С.А. В этот период на кафедре преподавали такие опытные специалисты и педагоги как Сеньков Н.О. (впоследствие в 1963-1971 гг. – Министр здравоохранения Казахской ССР), Мировалева З.Г. (позже ответработник Минздрава Казахской ССР).С 1949 г. по 1951 г. кафедру возглавлял Шкрадюк Г.Ф., с 1951 г. по 1959 г. кафедрой руководил кандидат медицинских наук, доцент Полянский А.Н. В этот период на кафедре работали 7 преподавателей, из которых тогда защитили кандидатские диссертации по проблемам истории медицины Палкин Б.Н., Чокин А.Р. В дальнейшие годы научно-практические интересы кафедры отвечали идеологии социалистического строительства, среди которых наиболее масштабными были мероприятия по всеобщей диспансеризации населения.
В 1959 г. кафедру возглавил Самарин Р.И., выпускник Казахского медицинского института, в 1960-1963 гг. – ректор Алма-Атинского государственного медицинского института. Под руководством доктора медицинских наук, профессора Самарина Р.И. было защищено 3 докторских (Чернобров П.Н., Гонопольский М.Х., Чокин А.Р.) и 28 кандидатских диссертаций. В эти годы окончили очную аспирантуру при кафедре и защитили кандидатские диссертации Исмаилов Ш.М., Слажнева Т.И., Макатова В.А., Саятова А.С., после заочной аспирантуры стали кандидатами медицинских наук Петров П.П., Костенко Г.Р., соискатели: ассистент Ильин И.В., работники Минздрава КазССР Иванова Н.И., Козырева Р.В., работники практического здравоохранения Индербиев М.Г., Душманов С.Х., Невель Н.Н. и др.
В 1969 г. из состава кафедры была выделена самостоятельная кафедра истории медицины, которую возглавил Чокин А.Р., доктор медицинских наук (1967 г.), профессор (1968 г.). Под руководством профессора Чокина А.Р. были защищены 2 докторские (Душманов С.Х., Свиридова Л.Е.) и 9 кандидатских (Шабдарбаева М.С., Ефремова Л.С., Жакупова М.А., Абылкасымов Е.А., Анамбаев И.А. и др.) диссертаций. В 1987 г. после ухода профессора Самарина Р.И. на пенсию две кафедры были вновь объединены в одну, заведующим которой стал профессор Чокин А.Р.
С 1993 г. кафедру возглавляет доктор медицинских наук, профессор Камалиев М.А.
В настоящее время кафедра общественного здравоохранения является основным подразделением университета, осуществляющим учебно-педагогическую, методическую, научно-исследовательскую, воспитательную работу, направленную на подготовку специалистов, обладающих теоретическими знаниями и практическими навыками по различным разделам общественного здоровья и здравоохранения, истории медицины.
Обучение студентов проводится на высоком методическом уровне и основано на типовых учебных программах дисциплины, составленных сотрудниками кафедры, которым следуют все медицинские вузы страны.
Кафедра оказывает практическую и методическую помощь органам и организациям здравоохранения. Проведены 56 циклов «Внедрение Единой национальной системы здравоохранения», 2 цикла «Избранные вопросы проведения экспертизы качества медицинских услуг», 4 цикла «Избранные вопросы организации внутрибольничного аудита с элементами аккредитации», выездные циклы «Организационные основы формирования здорового образа жизни» (г. Шымкент), «Актуальные проблемы управления ресурсами здравоохранения» (г. Актау), с 2016 г. – по внедрению обязательного социального медицинского страхования.
Сотрудниками кафедры проведена большая работа по созданию Музея истории Казахского национального медицинского университета им. С.Д. Асфендиярова, отражающего его становление, этапы развития и деятельности. Музей был торжественно открыт к 70-летию университета.